La Asociación Fundaciones de Navarra es una organización abierta, en la que todos sus asociados tienen los mismos derechos y obligaciones.
La representación de la Asociación corresponde a una Junta Directiva compuesta por siete miembros, entre los cuales se designa a un Presidente, un Vicepresidente, un Tesorero y un Secretario.
Con respecto a esta Junta Directiva, debe destacarse que aunque la duración de sus cargos sea de cuatro años, la misma será renovada parcialmente cada dos años, garantizándose de esta manera la continuidad de sus proyectos.
Actualmente está compuesta por los siguientes miembros:
D. IÑAKI MENDIOROZ CASALLO
Fundación Fundagro
D. IÑAKI ANTOÑANZAS BAZTÁN
Fundación Universitaria Navarra
Dña. ANA CARMEN ESPARZA HERMOSO
Fundación L'Urederra, Fundación para el desarrollo tecnológico y social
D. Iñaki ECHEVERRÍA LOPEZ
Fundación Ilundain
D. JAVIER FERNANDEZ VALDIVIELSO
Fundación Caja Navarra
D. antonio martinez de bujanda
Fundanel
D. patxi lasa
Fundación París 365
D. MARINO BARASOAIN
Secretario - Fundación Navarra para la excelencia